Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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