Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms