Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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