Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms