Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms