Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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