Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gtf3c6Q9D8P7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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