Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms