Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf2lQ9D478 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Odf2lQ9D478 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Odf2lQ9D478 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf2lQ9D478 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Odf2lQ9D478 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Odf2lQ9D478 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Odf2lQ9D478 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Odf2lQ9D478 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Odf2lQ9D478 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Odf2lQ9D478 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2lQ9D478 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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