Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms