Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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