Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms