Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms