Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ndufb9Q9CQJ8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ndufb9Q9CQJ8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ndufb9Q9CQJ8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ndufb9Q9CQJ8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms