Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms