Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nup155Q99P88 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup155Q99P88 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms