Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ubqln4Q99NB8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ubqln4Q99NB8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ubqln4Q99NB8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ubqln4Q99NB8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ubqln4Q99NB8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ubqln4Q99NB8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ubqln4Q99NB8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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