Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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