Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ms4a4dQ99N05 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ms4a4dQ99N05 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ms4a4dQ99N05 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ms4a4dQ99N05 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ms4a4dQ99N05 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4dQ99N05 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ms4a4dQ99N05 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ms4a4dQ99N05 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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