Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms