Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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