Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.4 ms