Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ciao1Q99KN2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ciao1Q99KN2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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