Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms