Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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