Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgtbQ8VD33 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SgtbQ8VD33 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms