Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms