Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms