Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf628Q8CJ78 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf628Q8CJ78 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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