Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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LgsnQ8CIX8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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LgsnQ8CIX8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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LgsnQ8CIX8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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LgsnQ8CIX8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LgsnQ8CIX8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LgsnQ8CIX8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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LgsnQ8CIX8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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LgsnQ8CIX8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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LgsnQ8CIX8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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LgsnQ8CIX8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LgsnQ8CIX8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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