Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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