Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bcas3Q8CCN5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Bcas3Q8CCN5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Bcas3Q8CCN5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Bcas3Q8CCN5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bcas3Q8CCN5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bcas3Q8CCN5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Bcas3Q8CCN5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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