Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufl1Q8CCJ3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms