Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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