Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms