Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms