Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc50Q810U5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms