Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms