Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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NanogQ80Z64 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms