Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pnma8aQ80VM8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms