Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms