Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms