Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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NipblQ6KCD5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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NipblQ6KCD5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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