Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
CltbQ6IRU5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms