Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms