Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6DFW0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6DFW0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms