Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms