Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms