Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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