Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atf3Q60765 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atf3Q60765 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atf3Q60765 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms